Эпоха Великих Реформ Александра II не могла не затронуть и такое чувствительное и значимое дело, как народное просвещение. Во «всеподданнейшем докладе» министра народного просвещения 5 марта 1856 г. об устройстве системы народного образования был намечен целый ряд намечавшихся преобразований по учебной части, как в существовавших средних учебных заведениях, так и в открытии новых – с реальным и специальным образованием, женских гимназий и т.п.

В Архангельске, не смотря на прежнюю неудачу реальных курсов, гимназия, на основании нового устава, была в 1865 г. обращена в реальную, только ученикам двух старших классов было позволено закончить обучение по прежнему уставу. Первый выпуск семилетней реальной гимназии состоялся в 1868 г., окончившие полный курс три воспитанника поступили, для продолжения своего образования, в технологический институт.

В 1873 г., после того как у реальных гимназий отняли их функцию подготовки учащихся к высшему образованию, в Архангельской гимназии начался обратный переход к классическому образованию, с древними языками как основой образования. В 1889 г. были введены уроки музыки, ставшие очень популярными, так, что даже возник гимназический оркестр, устраивавший литературно-музыкальные вечера. В 1900 г. число уроков по древним языкам вновь сократилось в пользу современных французского и немецкого.

Что касается уездных училищ, то Положением 31 мая 1872 г. их, как несоответствующие требованиям времени, было решено преобразовать в городские. На прохождение их полного курса полагалось 6 лет. В Архангельске данное преобразование произошло в 1875 г., когда здесь было организовано 3-х классное городское училище. В 1900 г. оно было дополнено временными педагогическими курсами, которые должны были готовить учителей для низших, приходских, училищ.

Приходских училищ в начале ХХ в. в Архангельске насчитывалось 6:

1) Соломбальское мужское;

2) женское 2-классное им. А.С. Пушкина;

3) Первое 1-классное мужское им. Н.В. Гоголя;

4) Второе 1-классное мужское;

5) Третье 1-классное женское;

6) Соломбальское женское. 

Семинария, как и все духовные учебные заведения России, подверглось после 1857 г. коренной реформе. В 1870 г. она была преобразована из трехклассной в шестиклассную. Туда разрешено было брать молодых людей всех сословий православного вероисповедания в возрасте от 14 до 16 лет. Тогда же было реформировано и Архангельское уездное духовное училище, став 4-х классным, куда принимались юноши в 10-12-летнем возрасте.

Реформы затронули и военное училище. По высочайше утвержденному положению от 24 декабря 1866 г. была открыта Архангельская военно-начальная школа на 200 воспитанников, четырехклассная с общеобразовательным элементарным курсом. Успешно окончившие курс переводились в специальные военные учебные заведения, малоуспешные выпускались писарями 2-го разряда, с обязательством прослужить в военном ведомстве не менее 6 лет, неудачники возвращались родителям, а при нежелании последних – направлялись в строевые части солдатами. 13 мая 1869 г. школа была упразднена, при чем успешные учащиеся были переведены в Санкт-Петербург, а неучи – возвращены родителям или направлены в солдаты.

Архангельское женское училище в январе 1864 г. стало именоваться Мариинским, в честь государыни-императрицы Марии Александровны, а в 1872 г. преобразовано в гимназию. В 1863 г. в городе возникло еще одно женское учебное заведение – Женское епархиальное училище для девочек из духовного сословия.