01.09.1990 – открыта школа № 31 с углубленным изучением английского языка и цикла эстетических предметов.

Директор гимназии – Попа Сергей Григорьевич, заслуженный учитель России.

29.12.1990 – переход школы № 31 на новый хозяйственный механизм по решению исполкома городского Совета народных депутатов.

28.08.1990 – школе № 31 присвоен статус школы-гимназии.

1991 – избран первый Совет самоуправления гимназии. Президент – Евгенова Галина. Разработана конституция гимназии.

1991 – начинает работу Школа раннего развития детей «Мальвина».

1992 – первый гимназический конкурс бальных танцев. Руководитель – Коптяев А.А. Всего было проведено 20 конкурсов.

1992 – посещение гимназии представителями из колледжей Лондона и Лестора.

1993 – гимназия принимает представителей образования Норвегии.

1993, апрель – Презентация научного общества учащихся «Ломоносовец», руководитель Мудрая Л.В.

1994 – гимназия принимает американскую делегацию.

1993-1994 – 10 класс (классный руководитель Маслова Р.И.) принимает участие в экспериментальной программе ПГУ «Университетский класс».

1994, апрель – открытие музея истории гимназии. Руководитель музея Ложкина А.И.

01.09.1995 – школа-гимназия № 31 аккредитована как Ягринская гуманитарная гимназия.

1995 – выпуск «Университетского класса» (совместный проект с ПГУ).

1995 – юные дизайнеры гимназии разработали и изготовили школьную форму для гимназистов. Руководители: Гельфанд Н.А., Вашукова Г.А.

1996 – гимназия награждена дипломом Олимпийского комитета России за участие во Всероссийском конкурсе, посвященном 100-летию Олимпийских игр.

06.03.1997 – первый творческий конкурс «Мисс гимназия». Победительница – Сошникова Светлана.

01.09.1997 – начало обучения в гимназии детей военных моряков ВМС Индии.

1999 – Ягринская гуманитарная гимназия переименована в МОУ «Ягринская гимназия».

2000, май – первый выпуск гимназической газеты «Гимназия у моря».

2003 – победитель областного конкурса «Лучшая организация военно-патриотической работы».

2004, декабрь – гимназия успешно прошла аттестацию.

2004 – запущена программа тестирования физического развития гимназистов «Навигатор здоровья».

2006 – гимназия становится победителем конкурса учебных заведений в рамках всероссийского национального проекта «Образование» и награждается президентским грантом в размере 1 миллиона рублей.

2006-2007 – переход на новый базисный учебный план в 1-х, 5-х, 10-х классах.

2006-2007 – введение единой школьной формы для гимназистов с 1 по 11 класс.

2006-2007 – оснащение гимназии новыми мультимедийными средствами и компьютерными программами. 

2009, ноябрь – гимназия успешно прошла аккредитацию учебного заведения.

2014, декабрь – организация деятельности школьной службы примирения.

2015 – возобновление работы школьного пресс-центра, издание школьной газеты «Гимназия у моря» в новом формате (редактор Е.Ф. Крутикова).

2015 – создание школьного военно-патриотического клуба «Русь» (руководитель А.И. Соколов). 

2017 – организация в гимназии волонтерского отряда «Розовый остров».

2018 – организация школьного спортивного клуба «Ягринец» (куратор В.Е. Пономаренко).

2019, апрель – танцевальному коллективу «Изюминка» исполнилось 20 лет (руководитель С.А. Ткачева, концертмейстер Н.В. Менц).

2020 – гимназия стала пилотной площадкой по реализации Федерального проекта «Цифровая образовательная среда» Национального проекта «Образование».

2021 – гимназия стала победителем муниципального конкурса по благоустройству территорий образовательных организаций, подведомственных Управлению образования Администрации Северодвинска 

2021, апрель – организация школьного лесничества (руководитель – учитель биологии А.В. Колпакова).

2022 – внедрение родительского контроля за организацией школьного питания.

2023 – создание первичной организации РДДМ.