По императорскому указу Екатерины II в 1786 году во всех губернских городах должны быть открыты четырехклассные главные народные училища, а во всех уездных городах – двухклассные малые народные училища.

В 1788 году в уездном городе Онеге было открыто первое светское общеобразовательное заведение на 30 учеников. Обучались письму, чтению, арифметике, славянской истории, Закону Божьему, рисованию, основам физики, геометрии. Курс обучения в народном училище был рассчитан на три года. В училище обучались дети священнослужителей, богатых мещан и купцов. Материальное обеспечение шло за счет местного городского общества трезвости.

Следующей ступенью в системе образования Онеги было приходское училище. Это одногодичное учебное заведение, но фактически обучение в нем продолжалось два-три года, в зависимости от усвоения программы учениками. Приходское училище давало первоначальные знания и умения в чтении, письме, арифметике. Мальчики и девочки обучались совместно.

Первое уездное училище в Онеге было открыто в 1824 году. В программу обучения вошли дополнительные предметы, необходимые для практической деятельности учеников: основы коммерческих наук, лесная промышленность, иностранный язык. Только в 1900 году Онежское двухклассное училище было реорганизовано в трехклассное, с ведением дополнительного параллельного ремесленного класса. В этом классе обучали сапожному, плотницкому, кожевенному ремеслам. Общее количество обучающихся в нем было 155 человек. В уездное училище принимались дети с восьми лет, обучение велось за счет государства.

В 1912 году городское уездное трехклассное училище было реорганизовано в Высшее начальное училище с четырехлетним сроком обучения. В него на платной основе принимались дети после окончания одноклассного приходского училища. В 1912 году министерство просвещения России присвоило Высшему начальному училищу имя М.В. Ломоносова. Оно имело достаточно оборудованные физический и естественно-исторический кабинеты, две библиотеки, фундаментальную и ученическую. В училище преподавали выпускники Санкт-Петербургского учительского института и Гатчинской учительской семинарии, училища технического рисования. Находилось Высшее начальное училище в деревянном одноэтажном здании на углу Соборного пр. (Кирова) и ул. Казначейская (Гоголя). В 1919 году при обстреле Онеги интервентами здание сгорело.

С 1920 года, после изгнания интервентов, стала расти сеть школ и число учащихся, обучающихся в них. Уже в 1921 году на территории Онежского уезда работало 54 школы и пункта по ликвидации неграмотности. Только за этот год в упомянутых школах и пунктах более 700 человек ликвидировали свою неграмотность.

После декрета Совнаркома «О сети учреждений наркомпроса», принятого в 1923 году, 7-я губернская партконференция (май 1924 г.) решила ввести всеобщее начальное образование. В результате этого в Онежском уезде в 1925 году работало 19 школ первой ступени с 1984 учащимися и две школы второй ступени с 606 учащимися.

В 1929 году в связи с новым административным делением образовался Онежский район Архангельской области.

В 1930 году в нашем районе было осуществлено всеобщее начальное обучение. Широкое школьное строительство позволило в 30-е годы реорганизовать начальные школы и школы первой ступени в неполные средние школы (Клещевская, Кодинская, Малошуйская, Подпорожская, Польская, Калгачинская, Мудьюжская, городские № 2 и № 3). Во всех типах школ занималось 3803 ученика. А в 1934 году число учащихся второй ступени возросло до 1337 человек, на селе число старшеклассников возросло вдвое.

Вместе с заботой о повышении материально-бытовых условий учителей в 30-е годы компартия и советское правительство проводят большую работу по повышению авторитета и роли учителя в обществе. Учителя избираются депутатами местных Советов (Ешкилева А.Н., Лукичов В.И., Фокин А.Л., Коротких Н.П.). В 1939 году орденом Ленина награждены Шангина Надежда Алексеевна и Колчина Мария Павловна.

В 1940-41 учебном году в районе уже работало 4 средних школы, 6 семилеток и 51 начальная школа. В школах трудилось 189 учителей, обучалось 5328 учеников.

В июне 1944 года принимается постановление СНК СССР «О мероприятиях по улучшению качества обучения в школах», в котором намечался ряд мер, направленных на повышение качества обучения.

Отделы народного образования одновременно выполняли функции культурно-просветительной работы. В ведении отдела были библиотеки, музеи, дома культуры, избы-читальни и сельские клубы. По решению облисполкома от 23.03.1945 № 384 были образованы областной и районные отделы культурно-просветительной работы при исполкомах, функции органов народного образования сузились до осуществления руководства школами, учреждениями дошкольного воспитания, детскими домами.

С 1949 года в СССР было введено всеобщее семилетнее обучение. В 1949-1950 учебном году вводится семилетний всеобуч в сельской местности.

В начале 1955-1956 учебного года в Онежском районе 60 школ, из них: 43 начальных, 13 семилетних, 4 средних.

В соответствии с Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 12 января 1965 года и решением сессии Онежского районного Совета депутатов трудящихся от 23 января 1965 года образовалось 2 отдела народного образования: Онежский городской отдел народного образования и Онежский районный отдел народного образования. В ведении Онежского ГОРОНО на 01.09.1965 находится 7 школ: 3 средних, 2 восьмилетних, 2 начальных, 2 ШРМ. На 01.02.1965 года РОНО имел в подчинении 52 школы: 2 средних, 13 восьмилетних, 37 начальных, 1 ШРМ, Вазенский детский дом, 1 детский сад. Учащихся 4007 человек.

В десятой пятилетке (1970-1975 годы) среди учителей города и района 28 Отличников народного образования, награждены медалями 40. Звание «Заслуженный учитель РСФСР» присвоено учителю начальных классов средней школы № 2 К.Л. Богдановой, награждена орденом «Знак Почета» Т.Н. Белых, учитель средней школы № 2, и Парамонова А.С. (Ярнемская средняя школа).

В связи с реорганизацией исполкома, на основании указа ПВС РСФСР от 21 марта 1989 года «О передаче Онежского района Архангельской области в административное подчинение Онежскому горсовету» РОНО и ГОРОНО были соединены в одно учреждение. Школы РОНО были переданы ГОРОНО. Всего школ 33, в том числе 4 средних, 16 восьмилетних, 13 начальных. Во всех школах обучается 6512 учащихся, работает 497 учителей. Руководство и контроль обеспечивает ГОРОНО в количестве 25 человек, в том числе 6 человек – методкабинет, 5 инспекторов, 1 зав. отделом, 13 бухгалтеров.

С 01 января 1996 года постановлением №1/к администрации г. Онеги и Онежского района от 03 января 1996 года отдел народного образования преобразован в Управление образования администрации муниципального образования «Город Онега и Онежский район».

На начало 2000-2001 учебного года работало 10 средних школ, 14 основных, 1 вечерняя средняя общеобразовательная школа, 1 коррекционная школа, 1 детский дом, Дом детского творчества, Дворец спорта для детей и юношества.

06.01.2006 года Управление образования администрации муниципального образования «Город Онега и Онежский район» переименовано в Управление образования администрации муниципального образования «Онежский муниципальный район».

На начало 2007-2008 учебного года учреждениями, подведомственными управлению образования, были 10 средних школ, 13 основных школ, вечерняя средняя (сменная) общеобразовательная школа, Центр дополнительного образования, Дворец спорта для детей и юношества, Информационно-методический центр.

С 13 апреля 2012 года Управление образования переименовано в муниципальное казенное учреждение «Управление образования администрации муниципального образования «Онежский муниципальный район». Сокращенное наименование – Управление образования Онежского района.

Структура системы образования Онежского муниципального района на 13.12.2023 года: 7 средних школ, 12 основных, 2 начальных, открытая (сменная) общеобразовательная школа, Центр дополнительного образования, спортивная школа, Центр психолого-педагогической, медицинской и социальной помощи. Учащихся в школах на 01.09.2023 года – 2730.

Руководители органов управления образованием:

• Рогов Евгений Яковлевич, заведующий РОНО с 02.02.1965 по 30.09.1973;

• Киселев Виктор Викторович, заведующий РОНО с 31.08.1973 по 29.08.1977; заведующий ГОРОНО с 01.11.1980 по 20.09.1983;

• Медведева Нина Александровна, заведующая РОНО с 29.08.1977 по 30.12.1983;

• Живчикова Галина Николаевна, заведующая РОНО с 01.01.1984 по 08.06.1989;

• Киприянова Маргарита Михайловна, заведующая ГОРОНО с 10.1976 по 11.1980;

• Суворова Татьяна Геннадьевна, заведующая ГОРОНО с 09.07.1984 по 09.01.1990;

• Коткин Иван Николаевич, заведующий ГОРОНО с 09.01.1990 по 18.10.1997;

• Цуркан Петр Якимович, начальник Управления образования с 20.10.1997 по 24.08.2001;

• Омегова Светлана Евгеньевна, начальник Управления образования с 01.09.2001 по 12.2003;

• Прохорова Антонина Петровна, начальник Управления образования с 04.01.2004 по 25.05.2016;

• Берковская Татьяна Ефимовна, начальник Управления образования с 26.05.2016 по 24.07.2022;

• Иконникова Наталья Вячеславовна, начальник Управления образования с 14 октября 2022 года по настоящее время.