До 1963 года на территории Урдомского поселкового совета не было ни одной средней школы, а многие дети лесозаготовителей получали по месту жительства только четырёхлетнее образование в приспособленных помещениях барачного типа в разбросанных по территории Верхнелупьинского леспромхоза посёлках.
Большому количеству детей, чтобы получить даже восьмилетнее образование, не говоря о среднем, приходилось обучаться в удалённых посёлках на другом берегу реки Вычегда. Между тем, с января 1963 года на территории Урдомского поселкового совета планировалось создать крупный рабочий посёлок Урдома, объединяющий несколько рядом расположенных населённых пунктов, общей численностью населения более 4,5 тыс. человек с количеством детей школьного возраста не менее 700. В то время как две восьмилетние школы, расположенные на территории, входящей в образуемый посёлок, даже при работе в две смены могли вместить максимум 400 человек. Руководству Верхнелупьинского леспромхоза Урдомского поссовета удалось добиться выделения средств на строительство здания новой школы в Урдоме. Выделенных средств хватало на строительство типового одноэтажного здания 8-летней школы на 320 мест.
В июне 1962 года строительство началось. В то же время перспективы развития быстрорастущей Урдомы требовали наличия школы в два раза большей по наполняемости. Смело взяв на себя ответственность, вопреки проекту, леспромхоз заложил усиленный фундамент здания с учетом постройки второго этажа. Ни разрешения, ни денег на его возведение не было. Только после публикации в газете «Правда» о сложившейся в посёлке проблеме были выделены дополнительные средства и принято решение о строительстве 2-этажного здания средней школы.
Строительство школы шло ударными темпами. Родители, учащиеся, учителя Няндской восьмилетней школы принимали в нем самое активное участие. На воскресниках и субботниках ими было отработано 870 человеко-дней. Несмотря на трудности в обеспечении материалами, отсутствие специалистов, 10 августа 1963 года школа была введена в строй.
Директором школы был назначен Евгений Михайлович Стрекаловский. На тот момент он был заведующим организационным отделом Котласского городского комитета КПСС, а Урдома в то время относилась к Котласскому промышленному району. Педагогический коллектив, которым ему предстояло руководить, в полном составе перешел из закрывающейся Няндской школы. Приехали и новые педагоги.
Евгений Михайлович Стрекаловский навсегда вошел в историю школы, поселка и района как директор-строитель. Он решительно брался за решение, казалось бы, невыполнимых задач и успешно доводил начатое до конца во благо школы и поселка. Благодаря его энтузиазму и поддержке руководства Верхнелупьинского леспромхоза школа за первые десять лет в разы увеличила свою полезную площадь. С 1967 по 1986 годы были построены: школьные мастерские, столовая, клуб, большой спортзал, здание интерната для проживания детей из ближайших посёлков, тир, автокласс с гаражами и подсобными пристройками, спортплощадка. Было переоборудовано под кабинет кулинарии и швейного дела административное здание. Значительная часть строек осуществлялась хозспособом силами работников и учащихся школы при масштабной поддержке шефов из Верхнелупьинского леспромхоза.
Урдомская школа первой в Ленском районе перешла на кабинетную систему обучения. А с 1970-х годов школа стала районным лидером в военно-патриотическом воспитании. В 1974 году сборная команда старшеклассников Урдомской школы впервые заняла первое место в областном финале игры «Орленок» и приняла участие во всесоюзном финале этой игры. Много славных страниц в историю школы 60-80-х годов ХХ столетия вписали школьные спортсмены и участники художественной самодеятельности, постоянно занимавшие первые и призовые места в районных соревнованиях и смотрах.
Начавшаяся в 80-х годах в СССР перестройка коснулась и школьной сферы. В 1987 году в школе впервые прошёл день самоуправления, кода ученики выпускных классов выполняли роль учителей. Начали применяться новые методики преподавания. В 1992 году в школе был открыт компьютерный класс, первый в школах Ленского района.
В 1994 году заслуженного учителя РСФСР Евгения Михайловича Стрекаловского, стаж которого на посту директора школы составил 30 лет, сменила Зинаида Михайловна Стенина. Уже с сентября 1994 года школа перешла на профильное обучение – первой из сельских школ Архангельской области. Десятиклассники выбирали будущую профессию, поступая в профильные классы. Первоначально их было открыто три: физико-математический, гуманитарный, естественнонаучный.
В 1997-1998 учебном году школа под руководством З.М. Стениной впервые среди общеобразовательных учреждений района получает лицензию на право обучения по программам профессионального обучения. Первоначально лицензионная подготовка осуществлялась по профессиональным программам: «Водитель автотранспортных средств категории В, С», «Швея II разряда», «Пользователь компьютера». Получение данной лицензии положило начало предоставления школой платных образовательных услуг как частным лицам, так и предприятиям. Это помогало школе развивать материально техническую базу за счет вырученных внебюджетных средств.
В 1998 году школа была официально зарегистрирована в качестве муниципального бюджетного образовательного учреждения (некоммерческой организации), обрела статус юридического лица, бухгалтерско-финансовую самостоятельность. В школе появилась своя бухгалтерия.
В 2003 году в Ленском районе впервые был проведен конкурс «Школа года», и Урдомская средняя школа стала безоговорочным победителем этого единственного в истории района конкурса, представив высокие результаты своей работы по всем направлениям.
С 2005 года в школе впервые в районе начинает действовать комплексная программа «Здоровье – это здорово!», распространяющаяся на всех участников образовательных отношений. Эта программа, претерпев два обновления, действует до настоящего времени, давая зримые результаты.
В 2006 году Урдомская средняя школа была признана одной из лучших школ в Архангельской области, реализующих инновационные программы – профильное и профессиональное обучение, и получила президентский грант в размере одного миллиона рублей на развитие образовательных инноваций.
13 декабря 2007 года стало трагической датой в истории Урдомской школы. В этот день в ее здании произошел крупный пожар. Огнем была уничтожена или серьезно повреждена большая часть основного здания школы, в которой было сосредоточено две трети учебных кабинетов. Трагедия показала, насколько сплочен школьный коллектив, какое важное значение для поселка имеет школа. Чтобы продолжить учебный процесс, задействованы были все отдельно стоящие здания школы, часть занятий решено было проводить в приспособленных помещениях Урдомы: в кабинетах Урдомского дома детского творчества, Урдомской основной школы, расположенной в другой части посёлка и даже в конторе леспромхоза.
Ремонт школы стал делом чести для всего рабочего поселка. На призыв о помощи откликнулись руководители местных предприятий, средства были выделены из областного и районного бюджетов. Уже в марте 2008 года ребята снова вошли в родную школу. Но уроки по-прежнему велись в две смены, что в условиях необходимости подвоза почти половины учащихся к месту учебы вызывало огромные сложности и делало невозможной нормальную организацию учебного процесса. Именно тогда впервые встал ребром вопрос о строительстве нового здания для Урдомской средней школы. В результате совместных усилий руководства школы, района и области строительство новой школы было включено в областную инвестиционную программу. Была достигнута договорённость с Газпромом о совместном финансировании строительства.
Несмотря на все проблемы и заботы школа продолжает жить и работать, ставить перед собой амбициозные цели и открывать новые горизонты. В марте 2009 года в школе создан военно-патриотический клуб «Звезда», играющий важную роль во внеурочной деятельности, возродивший в школе зарничное движение, ставший основой многих побед школьных команд на районных, региональных и межрегиональных соревнованиях. В этом же году школа стала победителем первого и единственного районного конкурса среди образовательных учреждений, реализующих инновационные и экспериментальные программы.
В 2010 году директором школы был назначен Владимир Александрович Додонов, выпускник школы. В сентябре 2010 года в школе начинается переход на новую модель профильного образования – обучение по индивидуальным образовательным траекториям в группах постоянного и смешанного состава.
В 2011 году в школе создан первый кадетский класс. Сразу после создания кадетского класса его команда приняла участие в областном слете кадетских классов и заняла второе место. Кадетские классы и военно-патриотический клуб «Звезда» стали визитной карточкой Урдомской средней школы. В 2012 году команда МБОУ «УСШ» впервые стала победителем областных соревнований «Школа безопасности». На следующий год команды школы впервые стали победителями областных соревнований «Юный спасатель» и «Юный водник». А еще через год – победителем областных соревнований «Юный пожарный». В 2014 году команда МБОУ «УСШ» впервые стала призёром межрегиональных соревнований Северо-Запада России «Школа безопасности» в г. Санкт-Петербург, а уже на следующий год – призёром межрегиональных соревнований Северо-Запада России «Юный спасатель» в г. Петрозаводск. В 2016 году команда школы впервые стала призёром межрегиональных соревнований Северо-Запада России «Юный пожарный» в г. Великий Новгород. С 2017 года на базе МБОУ «УСШ» создан и успешно работает зональный центр патриотического воспитания и подготовки молодёжи к военной службе при Региональном центре «Патриот». С 2020 года на территории школы проходят межрегиональные открытые соревнования «Военно-спасательные работы» на кубок школьного ВПК «Звезда». Эти соревнования стали традиционными, география их постоянно расширяется – от Санкт-Петербурга до Севастополя.
С 2012 года школа переходит на собственную критериально-уровневую систему оценки результатов образовательной деятельности учащихся. В декабре 2013 года впервые в истории школы и района на базе школы проходит межрайонный методический семинар школ юго-восточного методического куста Архангельской области, на котором школа делилась своим опытом оценочной деятельности на уроках и во внеурочной работе. В 2017 году на базе МБОУ «УСШ» коллективом школы был подготовлен и проведён межрайонный методический семинар, посвящённый системе проектной деятельности в школе – важнейшему направлению реализации новых образовательных стандартов. В феврале 2020 года на базе МБОУ «УСШ» впервые в истории района прошел областной семинар для руководителей и специалистов образовательных организаций и муниципальных органов управления в сфере образования. Темами семинара стали два направления работы школы: проектная деятельность обучающихся и развитие кадетского образования, движений патриотической направленности в общем и дополнительном образовании. На этом семинаре педагоги школы представили свой богатейший опыт в данных направлениях работы школы.
В январе 2015 года в результате реорганизации Урдомский дом детского творчества был присоединён к Урдомской средней школе как структурное подразделение дополнительного образования детей. Бывшее учреждение дополнительного образования получило новый импульс в развитии благодаря улучшению материальных и финансовых возможностей. Урдомская средняя школа в результате преобразования обогатилась новыми направлениями своей деятельности, роль дополнительного образования во внеурочной деятельности учащихся существенно увеличилась.
В 2012 году начинается строительство новой школы на улице Вычегодская.
Первого сентября 2016 года торжественно открылось новое здание школы. В него переместился весь образовательный процесс, включая дополнительное образование.
С 2017 года школа начала заниматься активным поиском внебюджетных средств для совершенствования образовательного процесса. Уже в 2018 году впервые был выигран областной грант, средства которого были направлены на развитие материально-технической базы ВПК «Звезда». С тех пор каждый год по итогам участия в конкурсах школа получает грантовые средства.
В 2020 году на средства выигранного школой областного гранта на школьной территории была сооружена Аллея воинской славы, выпущена книга «Звезда на доме», содержащая рассказы ветеранов Великой Отечественной войны и тружеников тыла Ленского района, а на территории бывшего Суходольского сельсовета установлена памятная стела, посвящённая детям войны.
Сентябрь 2020 года – в рамках национально проекта «Современная школа» на базе МБОУ «УСШ» создан Центр образования цифрового и гуманитарного профилей «Точка роста», который играет важнейшую роль в изучении компьютерных технологий в объединениях дополнительного образования.
С 2022 года школа вошла в федеральную программу «Цифровая образовательная среда» в рамках приоритетного национального проекта «Образование», по которой материально-техническая база школы пополняется специализированным компьютерно-цифровым оборудованием и компьютерными программами.
В школе на протяжении многих лет активно развиваются волонтёрское и экологическое направления работы.